تشخیص مولکولی و ژنوتیپ روتاویروس های جدا شده از موارد گاستروانتریت حاد کودکان در کرج

  زمینه: روتاویروس­های گروه A انسانی شایع­ترین عامل ویروسی اسهال شدید کودکان و نوزادان در سراسر جهان هستند.   هدف: مطالعه به منظور تعیین ژنوتیپ­های دخیل در عفونت روتاویروسی در کودکان مبتلا به گاستروانتریت در شهر کرج انجام شد.   مواد و روش­ها: این بررسی مقطعی بر روی تعداد 200 نمونه مدفوع کودکان زیر 5 سال با درگیری گوارشی مراجعه­کننده به بیمارستان شهید باهنر شهرستان کرج از مهر تا دی ماه 1390 انجام شد. میزان آلودگی به روتاویروس و نوع ژنوتیپ دخیل در موارد درگیری با روش Semi nested multiplex RT- PCR تعیین شد.   یافته­ها: از200 نمونه مورد بررسی، 27 نمونه (%5/13) به روتاویروس آلوده بودند. فراوانی ژنوتیپ­های مختلف عبارت بودند از: P[8] %44، G1 %15، G9 %15، G2 %8، G4 %8، G4G9 %8، P[4] %4 و P[6]P[8] %4 .   نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها، P[8] ، G1 و G9 به عنوان ژنوتیپ­های غالب بودند، ولی عدم تکثیر قطعات مربوط به پروتئین VP7 و نیز ژنوتیپ­های مختلف در میزان قابل توجهی از نمونه­های مثبت، لزوم استفاده از سایر پرایمرها و انجام بررسی­های مولکولی بیش­تر جهت انتخاب و طراحی پرایمرهای جدید را مطرح می­کند.